От бактерий и грибков вы аквариум не избавите. Они такие же полноценные обитатели водной системы. Они есть во всех аквариумах. Единственная разница, что в аквариуме со здоровой водой и оптимальным уходом, сбалансированным кормлением рыб они не могут атакавать рыб. Рыбу защищает имунитет и ранки сами затягиваются без проблем. А вот если вода содержит соединения азота, не регулярный уход, однообразное кормление, все это ослабляет рыбу и на любую незначительную царапку садиться зараза.